《黄帝阴符经》是学习奇门遁甲的朋友都知道并且必看的一部书，也是一部千古奇书，书里面不但记载了奇门遁甲深层理论的核心，而且还能检验是否已经入门奇门遁甲。虽然此书不知起于何时，但从古至今研究者从未间断过，“八仙”之一的张果老及《太白阴经》的作者李荃都对此书推崇不已，而易学研究与应用大师霍斐然先生曾以奇门遁甲释《黄帝阴符经》之秘，在当世易界无人能出其右。在书上“八卦甲子，神机鬼藏”也是用一句话便道出了奇门遁甲的神妙之处均藏在八卦和六十甲子当中。
由十天干与十二地支组合而成的六十花甲子构成的时间符号，而九宫八卦是空间为主要特征的信息符号。奇门遁甲将这二者按一定的规则组合在一起，包括天（九星）、地（九宫八卦）、人（九门）、神（九神）在内，构成了一个天地人神为一体，多维立体的动态宇宙思维模型，以模型中的时间信息为主，进行系统思辨，从而达到预测万事万物、甚至用于趋吉避凶的预测法。
奇门遁甲在古代传说是用来军事行军打仗的，《烟波钓叟歌》中也说“轩辕黄帝战蚩尤，涿鹿经年苦未休，偶梦天神授符诀，登坛致祭谨虔修。 神龙负图出洛水，彩凤衔书碧云里，因命风后演成文，遁甲奇门从此始”。诸葛亮也说：为将而不通天文，不识地利，不知奇门，不晓阴阳，不看阵图，不明兵势，是庸才也。奇门高级内容中的运筹便是需先用局以庙算之，分别求得上中下三策，上以谋治，中则伐交，下则攻城，此为兵家秘典也。
三十六计是中国古代兵家计谋的总结和军事谋略学的宝贵遗产，而奇门遁甲也在军事行军打仗中得以广泛应用，在战前用奇门遁甲进行模拟敌我双方情况，以提前拟定行军策略。比如我主动去攻打敌方，那盘局里我为客方，敌方为主方；天乙宫用神宫内含有诈格且天乙宫旺相有力，天乙宫用神宫逢杜门，那么便比较有利于实施瞒天过海之计谋；再如天乙宫旺相，宫内天地盘奇仪为庚加丙、辛加丁等，宫内乘九天，大局反吟或遇遁格，那么在对阵中便有利于实施趁火打劫之策略。当然行军打仗的运筹也只是奇门遁甲的一部分而已，真正的神机鬼藏该是姜子牙、诸葛亮、刘伯温等大能者才真正具备的。
那现在更多的是把奇门遁甲应用在商战，还有的是用来预测事业、婚姻、财运、学业、择吉等事情，至于真正懂得运筹调理的奇门高人更多的是以大隐隐于市的态度慢慢淡出人们的视线。不过即使是奇门预测一项，便是足够令很多人用毕生精力去探索了。
